一、 个人简介

刘仁义，博士生导师，现任福建农林大学未来技术学院海峡联合研究院农林大数据中心教授。中科院百人计划获得者，福建省高层次引进人才。获中科院动物所生态学硕士，美国乔治亚大学计算机科学硕士学位和遗传学博士学位。曾先后担任加州大学河滨分校助理教授和上海植物逆境生物学研究中心研究员。主要从事植物生物信息学研究，尤其是利用多组学数据研究基因和基因组进化，重要经济作物农艺性状的调控机制，植物与病原微生物的互作等。在国际著名学术期刊《Nature》、《Science》、《Nature Genetics》、《Nature Communications》、《PNAS》等杂志上发表论文90多篇。

   二、研究方向

   1、对重要经济作物的农艺性状和代谢物的调控元件进行鉴定和功能研究

    2、高通量转录组、基因组重测序、小RNA测序、全基因组DNA甲基化、蛋白质组学和代谢组学数据的生物信息学分析

    3、植物基因组中非编码RNA的鉴定和功能表征

    4、开发新型生物信息学软件和数据库

    5、植物基因和基因组的比较和进化分析

   三、近期代表性成果

1. Kong W, Jiang M, Wang Y, Chen S, Zhang S, Lei W, Chai K, Wang P, Liu R*, Zhang X*. (2022) Pan-transcriptome assembly combined with multiple association analysis provides new insights into the regulatory network of specialized metabolites in the tea plant Camellia sinensis. Hortic Res. PMID: 35795389.

2. Yu X, Xiao J, Chen S, Yu Y, Ma J, Lin Y, Li R, Lin J, Fu Z, Zhou Q, Chao Q, Chen L*, Yang Z*, Liu R*. (2020) Metabolite signatures of diverse Camellia sinensis tea populations. Nat Commun. PMID: 33149146

3. Zhao B, He L, Jiang C, Liu Y, He H, Bai Q, Zhou S, Zheng X, Wen J, Mysore KS, Tadege M, Liu Y, Liu R*, Chen J*. (2020) Lateral Leaflet Suppression 1 (LLS1), encoding the MtYUCCA1 protein, regulates lateral leaflet development in Medicago truncatula. New Phytol. PMID: 32170762

4. Wang P, Yao S, Kosami KI, Guo T, Li J, Zhang Y, Fukao Y, Kaneko-Kawano T, Zhang H, She YM, Wang P, Xing W, Hanada K, Liu R*, Kawano Y*. (2019) Identification ofendogenous small peptides involved in rice immunity through transcriptomics- and proteomics-based screening. Plant Biotechnol J. PMID: 31301098

5. Zhao W, Xu Z, Zhang X, Yang M, Kang L*, Liu R*, Cui F*. (2018) Genomic variations in the 3'-termini of Rice stripe virus in the rotation between vector insect and host plant. New Phytol. PMID: 29882354.

   四、承担主要课题

    2019-2022 国家重点研发计划，重要植物病害媒介昆虫携带新病原的发现及其潜在致病性研究（2019YFC1200503）子任务课题。

    2022-2025 福建省自然科学基金重点项目，茶树儿茶素调控网络与机制研究

    2022-2027 福建省科技厅研究项目，茶树重要代谢物调控机制研究

   五、教学情况

    主讲本科生课程《Python编程语言》

    参讲中国科学院大学英文课程《Epigenetics》3个学时，授课对象为来华留学生

   六、招生方向

    生物育种、生物技术

   七、联系方式

    福建农林大学未来技术学院海峡联合研究院   350002

    邮箱：ryliu@fafu.edu.cn