教授
菌草生态产业协同创新中心副主任、“闽江学者”特聘教授、“雏鹰计划”青年拔尖人才、省引进高层次人才、人社部高层次留学回国人才
《Molecular Cell》、《Genome Biology》、《Plant Physiology》杂志审稿人
联系方式：
福建农林大学海峡联合研究院 350002
Email: fjzhu@fafu.edu.cn
实验室介绍：
转录系统生物学实验室（Transysbio Lab）：http://hbmcsysbio.team
欢迎对AI/顺式元件组/表观组感兴趣的老师、同学加入
学习及工作经历：
2003–2010 清华大学 学士，硕士
2010–2013 东京大学 博士
2014–2018 卡罗林斯卡医学院 博士后
2018–2020 剑桥大学 Research Associate
2020– 福建农林大学海峡联合研究院 教授
主持项目：
2021-2023 福建省“闽江学者奖励计划”特聘教授
2021-2024 福建省重大专项（2021NZ029009，课题负责人）
2022-2025 福建省自然科学基金杰出青年项目（2022J06017）
2022-2025 国家自然科学基金面上项目（32170554）
2024-2027 国家自然科学基金面上项目（32370582）
2024-2027 人社部高层次留学回国人才资助
2025-2029 福建省“雏鹰计划”青年拔尖人才
2025-2027 国家重点研发计划（2024YFC3407200，课题负责人）
2026-2029 国家自然科学基金面上项目（3257040305）
研究方向：
植物顺式元件组（Cistrome）的
1）鉴定（高通量技术开发）
2）功能（转录调控机制解析）
3）应用（菌草种质创新）
研究内容：
转录系统生物学实验室（Transysbio Lab）的研究目标是——系统鉴定植物顺式元件组，解析其调控转录的机制，为育种提供定时、定点、定量调控关键基因表达的功能位点。并解析顺式元件组与其他表观组的互作机制。
目前为止已有超1000种植物基因组公开发表，除编码蛋白质的基因外，基因组中还存在大量”暗物质”——非编码调控元件，其功能有待系统解读。非编码基因组中的所有转录因子结合位点组成顺式元件组，是决定各基因时空特异性表达的关键。本课题组围绕植物中的顺式元件组及其互作因子（核小体、转录因子、lncRNA等）开展高通量研究，力求解析转录调控的普遍性规律。
起源于福建农林大学，由林占禧研究员开发的菌草技术，为国际贫困地区的生态治理与经济发展提供了中国方案。为进一步提升菌草的加工性能、产量、抗逆性等农艺性状，本实验室针对菌草关键生理过程，绘制表观基因组图谱，解析功能基因及其顺式元件，构建转录调控网络，为菌草种质创新中精确调节目的基因表达提供理论依据与育种靶标。
三、代表性成果
· F. Zhu, L. Farnung, E. Kaasinen, B. Sahu, Y. Yin, Bei. Wei, S.O. Dodonova, K.R. Nitta, E. Morgunova, M. Taipale, P. Cramer, J. Taipale, The interaction landscape between transcription factors and the nucleosome. Nature (IF = 41.577), 2018, 562, p76.
· S.O. Dodonova, F. Zhu, C. Dienemann, J. Taipale, P. Cramer, Nucleosome-bound SOX2 and SOX11 structures elucidate pioneer factor function. Nature 2020, 580, p669.
· F. Zhu, T. Nishimura, H. Eimura, and T. Kato, Supramolecular effects on formation of CaCO3 thin films on a polymer matrix. CrystEngComm (IF = 3.304), 2014, 16, p1496.
· F. Zhu, T. Nishimura, T. Sakamoto, H. Tomono, H. Nada, Y. Okumura, H. Kikuchi, and T. Kato, Tuning the stability of CaCO3 crystals with magnesium ions for formation of aragonite thin films on organic polymer templates. Chem. Asian J. (IF = 3.692), 2013, 8, p3232.
·F. Zhu, Y. Kong, J. Liang, C. Li, Y. Hu, Y. Zhou, X. Liu, L. Xie, and R. Zhang, Tuning calcite magnesium content by soluble shell matrices: Insights into biomineral impurity control. Mater. Sci. Eng. C (IF = 5.080), 2010, 30, p963.
四、承担主要课题
2021-2023 福建省“闽江学者奖励计划”特聘教授
2021-2024 福建农林大学学科交叉融合推动菌草科学及产业高质量发展（XKJC-712021030）子课题
2021-2024 福建省重大专项“菌草种质创新及其产业化利用关键技术研究与应用”（2021NZ0101）子课题
2022-2025 福建省自然科学基金杰出青年项目（2022J06017）
2022-2025 国家自然科学基金面上项目（32170554）
五、教学情况
主讲本科生课程《生物信息学程序设计》与《生物信息学程序设计实验》
参讲本科生课程《生物学基础及应用》，研究生课程《生命科学与研究方法》与《生命科学研究前沿》
六、招生方向
生物学、生态学
七、联系方式
福建农林大学海峡联合研究院 350002
Email: fjzhu@fafu.edu.cn
